e-Article
苏云金杆菌Ⅲ型抗癌晶体蛋白的分子模建 / Structural characterization of cancer cell-killing crystal protein Parasporin-3 from Bacillus thuringiensis
Document Type
Academic Journal
Source
计算机与应用化学 / COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY. 26(3):279-282
Subject
Language
Chinese
ISSN
1001-4160
Abstract
通过同源建模获得抗癌晶体蛋白Parasporin-3的仞始三维结构,利用分子动力学方法优化之.分析模建分子的结构.最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法评价模型.结果显示Parasporin-3蛋白模型分子具有3个结构域,与经典的杀虫晶体蛋白结构相似,蛋白模型分子中的键长、键角以及二面角的分布合理,与模版蛋白的主链а碳原子的均方根差RMSD值为0.486751,在合理范围之内,表明Parasporin-3蛋白模型良好.并对Ⅲ型抗癌晶体蛋白的两种蛋白的预测结构进行了比较.为抗癌晶体蛋白的抗癌的分子机制及其定向改造提供信息.