학술논문

The mitochondrial genome of the soybean cyst nematode, Heterodera glycines.
Document Type
Article
Source
Genome. Jul2011, Vol. 54 Issue 7, p565-574. 10p.
Subject
*SOYBEAN cyst nematode
*MITOCHONDRIA
*NUCLEOTIDE sequence
*ANIMAL genetics
*POLYMERASE chain reaction
*HETERODERIDAE
*GENE rearrangement
Language
ISSN
0831-2796
Abstract
Les auteurs ont séquencé complètement la région codante du génome mitochondrial de l' Heterodera glycines. La séquence obtenue mesure 14,9 kb et des évidences PCR indiquent que le génome entier serait composé d'une seule molécule circulaire d'environ 21-22 kb. Ce génome est le génome mitochondrial le plus riche en T jamais rapporté chez les nématodes, les T constituant plus de la moitié de tous les nucléotides sur le brin codant. Le génome compte également le nombre le plus élevé de suites poly(T) vu à ce jour (au meilleur de leur connaissance), avec 60 suites comptant plus de 12 T. Tous les gènes sont transcrits à partir du même brin mitochondrial. L'organisation du génome mitochondrial chez l' H. glycines affiche de nombreuses similarités avec celui du Radopholus similis, mais moins de similitude lorsque comparé à celui du Meloidogyne javanica. Très peu de frontières entre les gènes sont en commun avec le Globodera pallida ou le Globodera rostochiensis. Des séquences partielles du génome mitochondrial ont également été obtenues pour le Heterodera cardiolata (5,3 kb) et le Punctodera chalcoensis (6,8 kb), et ceux-ci présentaient une organisation identique à celle du H. glycines. Les auteurs ont trouvé des évidences PCR d'un génome mitochondrial circulaire miniature chez le P. chalcoensis, mais à de faibles niveaux et sans région non-codante. Des tels fragments de génome circularisés sont possiblement présents en faible nombre chez plusieurs nématodes, les génomes mitochondriaux multipartites constituant une transition vers une condition où ces cercles subgénomiques prédominent. [ABSTRACT FROM AUTHOR]