학술논문

Structural study of the therapeutic potential of protein-ligand interactions
Document Type
Dissertation/Thesis
Source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
Subject
Ligand-target prediction
Structural bioinformatics
Tuberculosis drug discovery
Drug resistance
Targeted cancer therapy
Pequeñas moléculas
Bioinformática estructural
Tuberculosis
Resistencia a tratamiento
Terapias dirigidas
Language
English
Abstract
La mayor´ıa de las funciones celulares est´an dirigidas por peque˜nas mol´eculas que selectivamente se unen a sus prote´ınas diana. Es tal su importancia que la intervenci´on farmacol´ogica de prote´ınas mediante peque˜nas mol´eculas es frecuentemente usada para tratar m´ultiples enfermedades. A continuaci´on presento a una tesis que utiliza un estudio tridimensional de las interacciones entre peque˜nas mol´eculas y prote´ınas para mejorar su relevancia terap´eutica. Espec´ıficamente, presento nAnnolyze, un m´etodo que predice interacciones prote´ına-ligando estructuralmente detalladas y a nivel de proteoma. El m´etodo ejemplifica su aplicabilidad a trav´es de la predicci´on de dianas terap´euticas humanas para todas las peque˜nas mol´eculas usadas como f´armacos aprobados por la FDA. Una segunda aplicaci´on de nAnnolyze en Mycobacterium tuberculosis identific´o las prote´ınas diana para dos conjuntos de compuestos con actividad contra dicha bacteria. Finalmente, la tesis describe un modelo computacional que predice mutaciones asociadas a c´ancer con alta probabilidad de conferir resistencia a una terapia dirigida. Adem´as, para aquellas mutaciones identificadas como responsables de producir resistencia, el modelo tambi´en sugiere terapias alternativas predichas como no resistentes. III
Programa de doctorat en Biomedicina