학술논문
SleepyFlyR: An R Package for Sleep and Activity Analysis in Drosophila
Document Type
Original Paper
Author
Source
Journal of Shanghai Jiaotong University (Science). :1-7
Subject
Language
English
ISSN
1007-1172
1995-8188
1995-8188
Abstract
摘要: 黑腹果蝇被广泛用于睡眠和节律的研究。在众多研究果蝇睡眠行为的工具中, 果蝇活动监测(DAM)系统凭借其简单且高效的特点被全世界的研究人员所认可。基于DAM系统生成的简单数据, 研究人员可以从中分析出大量描述睡眠和节律的参数。但是, 现有的DAM数据分析软件只覆盖了部分参数, 而且无法提供详细的个体数据以便用户使用其他绘图软件进行分析。因此我们开发了SleeyFlyR, 其特点包括:(1)简单易用并且附带UI文本, 方便用户进行操作;(2)提供全面的果蝇睡眠与活动分析, 涵盖多种参数;(3)生成睡眠和活动的活动度图;(4)绘制多天平均或者单天的睡眠与活动曲线;(5)给定实验组天数与对照组天数, 计算睡眠与活动参数的变化量;(6)分析结果同时包括总结数据和详细的个体数据, 且结果文件会根据用户的设置自适应命名。