부산대학교 도서관

생물정보학에서 대량의 서열을 분석하는 것은 중요한 분야이다. 최근 RNA-Seq(전사체 분석)이 RNA 서열의 구조와 기능을 밝혀내기 위해 사용된다. RNA 전사체 수준 분석은 유전체 DNA 수준에 비해 더욱 동적인데 그 이유는 RNA 분자가 유전자 발현과 단백질 정보에 직접적인 접근을 제공하기 때문이다. 그리나 기존의 생물학적 서열을 비교하는 도구들은 다중 전사체 서열들을 비교하는데 충분하지 않다. 본 논문은 불리언 질의를 사용해 전사체를 비교하고 질의 결과를 시각화하는 새로운 접근법을 가지는 도구를 제안한다. 불리언 질의를 사용함으로써 사용자는 복잡한 비교 조건을 기본적인 불리언 연산의 조합으로 쉽게 만들 수 있다. 이 도구는 전사체 데이터를 분석하는데 효과적으로 사용될 수 있을 것이다.
In Bioinformatics, analyzing massive sequences is important field. Recently, RNA-Seq(Transcriptome Sequencing) is used to identify structure and function of RNA sequences. RNA transcript level analysis is more dynamic than genomic DNA level because RNA molecules provide direct access to gene expression and protein information. But typical biologic sequence comparison tools are insufficient to compare multiple transcript sequences.In this thesis, I suggest a tool with novel approach to compare transcripts using boolean query and visualize results of the query. Using boolean query, user can easily make a complicated comparison condition with a combination of basic boolean operations. Proposed tool will be used efficiently to analysis transcript data from different mapping methods using same sample and different samples of same genome.