학술논문
Genetische Unterschiede zwischen zerebralem Blutvolumen (CBV) und Gefassgrosse (Vessel Size) beim Glioblastoma multiforme
195
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Document Type
Academic Journal
Author
Source
Clinical Neuroradiology. September 2016, Vol. 26 Issue S1, pS79, 1 p.
Subject
Language
English
ISSN
1869-1439
Abstract
K.Guggenberger (1), D. H. Heiland (2), C. P. Simon-Gabriel (3), D. Pfeifer (4), A. Weyerbrock (5), H.t Urbach (6), I. Mader (7) (1) Universitatsklinikum Freiburg, Abteilung fur Neuroradiologie, Klinik fur [...]
Ziel der vorliegenden prospektiven Fallstudie war es, genetische Subgruppen des Glioblastoms bzw. deren spezifische Signaltransduktionswege zu identifizieren, die sich in den MR-Perfusionsparametern Gefassgrosse (Vessel Size: VS) bzw. zerebrales Blutvolumen (CBV) ausdrucken, um so mittels MR-Bildgebung Ruckschlusse auf die genetische Subklassifikation ziehen zu konnen. Nach praoperativer Messung von VS und CBV bei 21 Glioblastom-Patienten erfolgte die RNA-Analyse der mittels navigationsgestutzter Gewebeentnahme gewonnenen Proben durch die Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA) und deren Zugehorigkeit zum einem entsprechenden Genregulationsnetzwerk. Anschliessend wurden die durch die Gene Set Enrichment Analyse (GSEA) gewonnen Daten bezuglich Pathway-Aktivierung und biochemischer Funktionen mit 484 Glioblastom-Gewebeproben aus der Datenbank des The Cancer Genome Atlas (TCGA) abgeglichen. WGCNA identifizierte 10 Gen-Cluster mit hoher Korrelation zu CBV sowie VS. Ein mit Hypoxie assoziierter Cluster korrelierte ausschliesslich mit der VS. Ein weiterer, mit Aktivierung des EGF-Pathways (epidermalen Wachstumsfaktors) und mit Epithelial-mesenchymaler Transition assoziierter Cluster korrelierte ausschliesslich mit dem CBV. Daruber hinaus ergab sich fur Patienten mit erhohtem CBV und VS in erster Linie eine mesenchymale Genexpression, Abbildung 1. Zusammenfassend spiegeln die Perfusionsparameter CBV und VS unterschiedliche genetische Subgruppen des Glioblastoms wider, wobei das CBV sich insbesondere fur die Darstellung von Angiogenese-Pathway-Aktivierung, die VS sich eher fur die Detektion von Hypoxiegenen eignet. In der heat map lassen sich jeweils eine Zuordnung in 2 Cluster erkennen, von denen jeweils einer mehr Tumore mit mesenchymaler Expression (roter Balken unter der heat map) und einer mehr Tumore mit proneuraler Expression (gruner Balken) enthalt. Die drei Tumore mit IDH Mutation finden sich in alle in der proneuralen Klassifikation wieder.
Ziel der vorliegenden prospektiven Fallstudie war es, genetische Subgruppen des Glioblastoms bzw. deren spezifische Signaltransduktionswege zu identifizieren, die sich in den MR-Perfusionsparametern Gefassgrosse (Vessel Size: VS) bzw. zerebrales Blutvolumen (CBV) ausdrucken, um so mittels MR-Bildgebung Ruckschlusse auf die genetische Subklassifikation ziehen zu konnen. Nach praoperativer Messung von VS und CBV bei 21 Glioblastom-Patienten erfolgte die RNA-Analyse der mittels navigationsgestutzter Gewebeentnahme gewonnenen Proben durch die Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA) und deren Zugehorigkeit zum einem entsprechenden Genregulationsnetzwerk. Anschliessend wurden die durch die Gene Set Enrichment Analyse (GSEA) gewonnen Daten bezuglich Pathway-Aktivierung und biochemischer Funktionen mit 484 Glioblastom-Gewebeproben aus der Datenbank des The Cancer Genome Atlas (TCGA) abgeglichen. WGCNA identifizierte 10 Gen-Cluster mit hoher Korrelation zu CBV sowie VS. Ein mit Hypoxie assoziierter Cluster korrelierte ausschliesslich mit der VS. Ein weiterer, mit Aktivierung des EGF-Pathways (epidermalen Wachstumsfaktors) und mit Epithelial-mesenchymaler Transition assoziierter Cluster korrelierte ausschliesslich mit dem CBV. Daruber hinaus ergab sich fur Patienten mit erhohtem CBV und VS in erster Linie eine mesenchymale Genexpression, Abbildung 1. Zusammenfassend spiegeln die Perfusionsparameter CBV und VS unterschiedliche genetische Subgruppen des Glioblastoms wider, wobei das CBV sich insbesondere fur die Darstellung von Angiogenese-Pathway-Aktivierung, die VS sich eher fur die Detektion von Hypoxiegenen eignet. In der heat map lassen sich jeweils eine Zuordnung in 2 Cluster erkennen, von denen jeweils einer mehr Tumore mit mesenchymaler Expression (roter Balken unter der heat map) und einer mehr Tumore mit proneuraler Expression (gruner Balken) enthalt. Die drei Tumore mit IDH Mutation finden sich in alle in der proneuralen Klassifikation wieder.