부산대학교 도서관

Background: The B.1.1.7 SARS-CoV-2 variant results in spike gene target failure (SGTF) in reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-PCR) assays. Few studies have been published on the clinical impact of B.1.1.7/SGTE Aims: To assess the incidence of B.1.1.7/SGTF and its associated clinical characteristics among hospitalized COVID-19 patients. Methods: This observational, single-centre, cohort study was conducted between December 2020 and February 2021 and included 387 hospitalized COVID-19 patients. The Kaplan-Meier method was used for survival analysis, and logistic regression to identify risk factors associated with B.1.1.7/SGTF. Results: By February 2021, B.1.1.7/SGTF (88%) dominated the SARS-CoV-2 PCR results in a Lebanese hospital. Of the 387 eligible COVID-19 patients confirmed by SARS-CoV-2 RT-PCR, 154 (40%) were non-SGTF and 233 (60%) were B.1.1.1.7/SGTF; this was associated with a higher mortality rate among female patients [22/51 (43%) vs 7/37 (19%); P = 0.0170]. Among patients in the B.1.1.7/SGTF group, most were aged [greater than or equal to] 65 years [162/233 (70%) vs 74/154 (48%); P < 0.0001]. Independent predictors of B.1.1.7/SGTF infection were hypertension (OR = 0.415; CI: 0.242-0.711; P = 0.0010), age [greater than or equal to] 65 years (OR = 0.379; CI: 0.231-0.622; P < 0.0001), smoking (OR = 1.698; CI: 1.023-2.819; P = 0.0410), and cardiovascular disease (OR = 3.812; CI: 2.215-6.389; P < 0.0001). Only non-SGTF patients experienced multi-organ failure [5/154 (4%) vs 0/233 (0%); P = 0.0096]. Conclusion: There was a clear difference between the clinical features associated with B.1.1.7/SGTF and non-SGTF lineages. Tracking viral evolution and its clinical impact is crucial for proper understanding and management of the COVID-19 pandemic. Keywords: COVID-19, in-hospital mortality, SARS-CoV-2, spike gene target failure, variant B.1.1.7 Contexte : Le variant B.l.1.7 SARS-CoV-2 entraîne l'absence de détection du gène S (SGTF) dans les tests de réaction en chaîne par polymerase après transcription quantitative inverse (RT-PCR). Peu d'études ont été publiées sur l'impact clinique du SGTF/B 1.1.7. Objectifs : ?‰valuer l'incidence du SGTF/B 1.1.7 et ses caractéristiques cliniques associées chez les patients hospitalisés atteints de COVID-19. Méthodes : La présente étude observationnelle de cohorte monocentrique a été menée entre décembre 2020 et février 2021 auprès de 387 patients hospitalisés atteints de COVID-19. La méthode de Kaplan-Meier a été utilisée pour l'analyse de survie et la régression logistique afin de déterminer les facteurs de risque associés au SGTF/B.1.1.7 Résultats: En février 2021, le SGTF/B.1.1.7 (88%) a dominé les résultats de la PCR du SARS-CoV-2 dans un hôpital libanais. Sur les 387 patients éligibles atteints de COVID-19 confirmés pour le SARS-CoV-2 par RT-PCR 154 (40%) étaient négatifs pour le SGTF et 233 (60%) étaient positifs pour le SGTF/B 1.1.7 ; cela était associé à un taux de mortalité plus élevé chez les femmes [22/51 (43%) contre 7/37 (19%) ; p = 0,0170]. Parmi les patients du groupe SGTF/B 1.1.7 la plupart étaient âgés de 65 ans et plus [162/233 (70%) contre 74/154 (48%) ; p < 0,0001]. Les facteurs prédictifs indépendants de l'infection par le B.1.1.7/SGTF étaient l'hypertension (OR = 0,415 ; IC : 0,242-0,711 ; p = 0,0010), le fait d'être âgé de 65 ans et plus (OR = 0,379 ; IC : 0,231-0,622 ; p < 0,0001), le tabagisme (OR = 1,698 ; IC : 1,023-2,819 ; p = 0,0410) et les maladies cardiovasculaires (OR = 3,812 ; IC : 2,215-6,389 ; p < 0,0001). Seuls les patients négatifs pour le SGTF présentaient une défaillance multiviscérale [5/154 (4%) contre 0/233 (0%) ; p = 0,0096]. Conclusion : Il y avait une différence claire entre les caractéristiques cliniques associées aux lignées B.1.1.7/SGTF et celles ne présentant pas de SGTE Le suivi de l'évolution virale et de son impact clinique est essentiel à la compréhension et à la gestion de la pandémie de COVID-19.
Introduction The highly pathogenic severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) emerged in Wuhan, China, and constituted a global public health emergency (1,2). Worldwide, reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-PCR) [...]