학술논문
番茄CKX基因家族生物信息学分析 / Bioinformatics Analysis of CKX Gene Family in Tomato
Document Type
Academic Journal
Author
Source
现代农业科技 / XianDai NongYe KeJi. (12):56-62
Subject
Language
Chinese
ISSN
1007-5739
Abstract
植物细胞内的细胞分裂素受到细胞分裂素脱氢酶/氧化酶(CKX)的调节,维持植物体内细胞分裂素动态平衡.为探究番茄基因组中CKX基因(SlCKX)家族成员的信息,本研究通过现代生物信息学分析,对番茄中CKX基因家族进行鉴定和分析.结果表明,在番茄全基因组中鉴定出 9 个CKX基因家族成员,蛋白长度在453～553 个氨基酸之间,编码蛋白分子量在 51660.72～52493.64 kD之间,为亲水性蛋白;番茄CKX基因分在4 个亚族内,且SlCKX家族成员中含有 3～5 个内含子以及 4～6 个外显子;9 个番茄CKX家族基因不均匀地分布在 5 条染色体上,番茄CKX基因家族包含 11 种顺式作用元件,其中脱落酸响应元件分布最广.本研究可为番茄CKX基因家族的功能和应用研究提供一定参考.