학술논문
不同成熟度无花果比较转录组分析 / Comparative transcriptome analysis of Ficus carica fruits with different maturity
Document Type
Academic Journal
Author
刘姚; 李彭生; 张金云; 阳桂芳; 张方秋; 杨光; LIU Yao; LI Pengsheng; ZHANG Jinyun; YANG Guifang; ZHANG Fangqiu; YANG Guang
Source
经济林研究 / Nonwood Forest Research. 41(3):214-223
Subject
Language
Chinese
ISSN
1003-8981
Abstract
[目的]为揭示无花果果实成熟的分子机制及无花果果实品质改良和新品种选育提供参考.[方法]以不同成熟度(S1:八成熟,S2:九成熟,S3:全熟)的'芭劳奈'无花果果实为材料,利用Illumina高通量测序技术,进行转录组测序和数据de novo组装,对不同成熟度果实的Unigene进行比较,筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行转录因子分析、GO富集分析和KEGG富集分析.[结果]通过测序共获得 65 676 条Unigene序列,筛选出差异表达基因 15 620 个,其中八成熟与九成熟果实有 1 508 个差异表达基因,九成熟与全熟果实有 11 385 个差异表达基因.GO富集分析结果表明:八成熟与九成熟果实的差异表达基因主要富集在核糖体相关的细胞组分以及糖酵解、ADP和ATP代谢等过程;九成熟与全熟果实的差异表达基因主要富集在植物细胞壁相关的细胞组分以及果实成熟、发病原和谷氨酸代谢等过程.KEGG分析结果表明:八成熟与九成熟果实的差异表达基因主要富集在糖酵解、丙酮酸代谢、碳代谢和氨基酸合成代谢等途径;九成熟与全熟果实的差异表达基因主要富集在糖酵解、脂肪酸代谢、淀粉和蔗糖代谢以及氨基酸合成代谢等途径.[结论]筛选出的调控果实成熟的关键基因包括26个与乙烯合成及信号转导相关基因,44个与ABA合成及信号转导相关的基因.