학술논문
马铃薯bZIP家族的鉴定与表达分析 / Identification and expression analysis of bZIP family in potato
Document Type
Academic Journal
Author
Source
江苏农业学报 / Jiangsu Journal of Agricultural Sciences. 38(6):1453-1464
Subject
Language
Chinese
ISSN
1000-4440
Abstract
为探索马铃薯中bZIP的功能,对马铃薯bZIP基因家族进行鉴定,分析其系统进化关系、染色体定位、植物组织表达模式,并对非生物逆境胁迫条件下的转录组数据进行分析.利用荧光定量PCR技术检测12个bZIP基因在马铃薯根、茎、叶以及在干旱、低钾、高盐、脱落酸(ABA)和H2 O2等胁迫下的表达情况.通过对马铃薯bZIP转录因子进行全基因组检索,得到104个bZIP基因家族成员.其编码的bZIP转录因子保守结构域长度为21～79 aa,相对分子质量为13088.03～88180.52,等电点为5.02～9.96,均属于亲水蛋白质.利用在线软件MEME对bZIP家族成员的蛋白质全长氨基酸序列进行结构分析,并根据其结构进行相似性聚类,共得到20个Motif,其中Motif1存在于104个bZIP中,为bZIP家族的特征基序.根据进化树分析结果,将马铃薯bZIP家族分为10个亚族.基于转录组数据的表达模式分析结果表明,马铃薯bZIP成员广泛参与ABA、盐、干旱等非生物胁迫响应.qPCR分析结果显示,马铃薯bZIP家族成员还能够在低钾、H2 O2胁迫应答中发挥作用.综合分析可知,马铃薯bZIP家族基因广泛参与了非生物胁迫响应,研究结果为马铃薯bZIP家族的功能研究奠定了基础.