학술논문
苜蓿miRs表达谱分析及跨界潜力miRs初步筛选 / Analysis on miRs Expression Profiles of Alfalfa and Screening of Trans-border Potential miRs
Document Type
Academic Journal
Author
Source
中国农业科技导报 / Journal of Agricultural Science and Technology. 25(7):43-53
Subject
Language
Chinese
ISSN
1008-0864
Abstract
为探明宁夏苜蓿耐旱新品系'新盐 52号'(XY52)的miRNA表达谱,并筛选有跨界研究价值的microRNA(miR),以'中苜一号'(ZM1)为参照,对ZM1和XY52进行高通量miRs组学测序和分析(RNA-seq);通过生物信息学技术筛选差异表达miRs及预测靶基因,并对预测靶基因进行GO和KEGG富集分析;然后运用RT-qPCR技术对10个miRs进行检测和分析.结果表明,①成功构建了2种苜蓿miR表达谱,ZM1和XY52中分别检测到656和703个miRs,其中已知miRs分别为433和480个,新预测miRs数量均为233个;②2种苜蓿中共检测到21个差异表达miRs,其中novel-miR54、miR156f和miR166a表达量较高,并且novel-miR54在XY52中表达量极显著高于ZM1(P<0.01),miR156f在ZM1中的表达量极显著高于XY52(P<0.01);③5个已知有跨界调控功能miRs中,miR166a在ZM1和XY52中均为表达水平最高的miR;品种之间,miR166a在XY52中的表达量较ZM1极显著上调(P<0.01);④KEGG通路和GO功能富集分析发现差异表达的21个miRs共预测得到623个靶基因,主要与RNA转运、ABC转运蛋白和泛素介导的蛋白水解等信号通路有密切关系.以上结果为解析苜蓿品种miRs差异表达及研究苜蓿源miRs调控奶牛体内基因奠定初步基础.