학술논문
猪Nramp1基因及其蛋白生物信息学分析 / Bioinformatics analysis of pig Nramp1 gene and its protein
Document Type
Academic Journal
Author
Source
安徽科技学院学报 / Journal of Anhui Science and Technology University. 37(5):20-25
Subject
Language
Chinese
ISSN
1673-8772
Abstract
目的:分析猪Nramp1基因序列及其编码蛋白的结构.方法:用生物学软件分析猪Nramp1基因编码区序列,并预测猪Nramp1蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、磷酸化位点、N-糖基化位点、互作蛋白,并分析7个哺乳动物Nramp1蛋白序列的同源性.结果:猪Nramp1基因编码区长1617碱基对(bp),G-C含量(58.50％)高于A-T含量(41.50％).猪Nramp1蛋白分子量为58829.22 u,等电点为8.01,不稳定系数为44.76,平均亲水系数为0.605,氨基酸组成以亮氨酸数量(85个)最多;二级结构主要为α螺旋(占55.58％)和延伸链(占14.13％),没有信号肽,含12个跨膜区,有40个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化位点,与其互作的有TLR4等蛋白.猪Nramp1蛋白序列与水牛、普通牛、山羊、人、小鼠、绵羊的同源性分别为87.2％、88.1％、87.7％、86.8％、84.4％和88.5％.结论:该研究结果为分析猪Nramp1基因及其蛋白的结构和功能提供基础.