학술논문
张家界和湘西地区鲜广椒细菌菌群多样性比较分析 / Comparative analysis of bacterial community diversity in zha-chili samples collected from Zhangjiajie and Xiangxi region
Document Type
Academic Journal
Author
Source
中国酿造 / China Brewing. 42(9):68-72
Subject
Language
Chinese
ISSN
0254-5071
Abstract
该研究采用MiSeq测序技术对采集自湖南张家界地区的18个鲊广椒样品进行高通量测序,同时从MGRAST数据库中下载12个湖南湘西地区鲊广椒的高通量测序数据,在将数据合并分析的基础上,通过多种数据方法对张家界和湘西2个地区鲊广椒菌群结构进行比较分析,探究不同地区鲊广椒细菌群落结构的异同.结果表明,2个地区鲊广椒中细菌类群丰度和多样性均无显著差异(P＞0.05),但其细菌类群结构存在显著差异(P＜0.05).Mann-Whitney检验发现,张家界地区鲊广椒中乳酸杆菌(Lactobacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)相对含量分别为93.04％和1.78％,较之湘西地区显著偏高(P＜0.05),而醋酸杆菌(Acetobacter)相对含量仅为0.03％,较之湘西地区显著偏低(P＜0.05).线性判别分析(LDA)结果表明,乳酸杆菌(Lactobacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)可作为张家界地区鲊广椒中的生物标志物,醋酸杆菌(Acetobacter)为湘西地区鲊广椒中的生物标志物.PICRUSt分析发现,代谢途径E(氨基酸转运与代谢)和K(转录)在张家界地区鲊广椒细菌类群中显著高表达(P＜0.05).由此可见,2个地区鲊广椒细菌类群和功能存在明显差异.