학술논문

系统分析多组织转录组鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因 / System Analysis of Multi Tissue Transcriptome to Identify Key Genes Affecting Porcine Fat Deposition
Document Type
Academic Journal
Source
畜牧兽医学报 / Acta Veterinaria Et Zootechnica Sinica. 53(6):1702-1711
Subject
松辽黑猪
多组织
转录组
系统分析
脂肪沉积
Language
Chinese
ISSN
0366-6964
Abstract
旨在挖掘影响松辽黑猪脂肪沉积的关键基因及脂肪、肝和肌肉在体内的功能.本研究选择体重100 kg左右健康且背膘厚差异显著的6头(高、低各3头)松辽黑猪为试验动物,利用高通量转录组测序技术检测其脂肪、肝和背最长肌组织中基因的表达水平,鉴定不同脂肪沉积猪和不同组织中的差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能.结果表明,在不同分组的猪中发现135个差异表达基因,其中部分参与了 PPAR信号通路、AMPK信号通路、代谢通路、脂肪酸代谢和甘油代谢等通路.经生物学功能分析发现,EHHADH、ME1、SCD、OLR1、PHGDH、 ACLY、LEP和CYP超家族基因等基因为影响猪脂肪沉积的关键基因.在不同组织的差异表达表达基因中,脂肪组织中高表达的基因显著富集在胰岛素信号通路、MAPK信号通路、三羧酸循环、氧化磷酸化等通路;肝中高表达基因显著富集在多种物质的代谢、脂肪酸的降解、氨基酸的合成等通路;背最长肌中高表达的基因主要参与了蛋白质的降解、PI3K-Akt信号通路、氧化磷酸化通路、Wnt信号通路、磷脂酰肌醇信号通路等通路.不同组间差异表达基因分析结果提示,EHHADH、ME1、SCD、OLR1、PHGDH、ACLY、LEP和 CYP超家族基因等基因是影响脂肪沉积的关键基因;不同组织间差异表达基因表明,脂肪组织是脂肪合成的主要部位,而肝和肌肉组织主要涉及脂肪酸的降解.本研究结果对脂肪性状的遗传改良、机理解析有一定意义.