학술논문
靶向高通量测序鉴定非结核分枝杆菌菌种的应用价值 / Application value of targeted next-generation sequencing for identification of non-tuberculous mycobacteria strains
Document Type
Academic Journal
Author
陈华; 陈品儒; 李艳阳; 邓政先; 许柳清; 梁锋; 胡锦兴; Chen Hua; Chen Pinru; Li Yanyang; Deng Zhengxian; Xu Liuqing; Liang Feng; Hu Jinxing
Source
中国防痨杂志 / Chinese Journal of Antituberculosis. 45(4):362-366
Subject
Language
Chinese
ISSN
1000-6621
Abstract
目的:探讨靶向高通量测序(targeted next-generation sequencing,tNGS)技术在非结核分枝杆菌菌种鉴定的应用价值.方法:收集2021年7月至2022年9月,在广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心住院患者的428份标本进行研究,其中,痰标本312份,支气管肺泡灌洗液标本116份.对上述标本进行tNGS分枝杆菌鉴定(简称"tNGS法")和微生物培养(BACTEC MGIT 960)+DNA微阵列芯片法(简称"培养法")进行分枝杆菌菌种鉴定,并对2种方法检测结果进行比较.结果:(1)tNGS法和培养法分别分离出结核分枝杆菌102份和56份,非结核分枝杆菌150份和182份.(2)tNGS法的分枝杆菌检出率为58.88％(252/428),与培养法阳性率55.61％(238/428)比较,差异无统计学意义(x2=0.936,P=0.333).(3)以培养法为参照标准,tNGS法检测分枝杆菌的敏感度、特异度、假阴性率、假阳性率、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为80.65％(200/248)、92.22％(166/180)、22.43％(48/214)、6.54％(14/214)、93.46％(200/214)、77.57％(166/214)和 0.710.结论:tNGS法与培养法一致性良好,具备很好的时效性、敏感度、特异度,利于早期制定临床治疗方案.