학술논문
Development of a sandwich hybridization assay for the identification and quantification of red drum ( Sciaenops ocellatus) eggs: a novel tool for fishery research and management.
Document Type
Article
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Source
Subject
*RED drum (Fish)
*FISH eggs
*FISHERY management
*RIBOSOMAL RNA
*DNA probes
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Language
ISSN
0706-652X
Abstract
L'identification et la quantification des œufs sont des aspects clés de la compréhension de la dynamique du frai et du recrutement d'espèces de poissons d'importance économique. L'étude décrit la mise au point d'une nouvelle technique moléculaire d'identification des œufs de poissons à nageoires qui élimine la nécessité du recours à la microscopie, une étape coûteuse en termes de temps. L'essai d'hybridation sandwich (EHS) fait appel à deux oligonucléotides ciblant l'ARN ribosomique (ARNr) pour détecter directement l'ARNr non purifié et non amplifié. Des sondes ont été conçues pour complémenter la région de l'espaceur transcrit interne (ETI) du tambour rouge ( Sciaenops ocellatus), un important poisson sportif au sujet duquel peu de renseignements sur le frai et la reproduction sont disponibles. Des procédures d'homogénéisation ont été modifiées pour perturber le chorion des œufs, et l'essai en résultant détectait les œufs et tissus de S. ocellatus sans réactivité croisée. Les courbes d'étalonnage étaient linéaires ( y450 = 0,001 x + 0,054; R2 = 0,999), présentant un potentiel d'utilisations quantitatives, et la limite de détection inférieure était de 5 œufs·mL−1 d'homogénat. Le stade ontogénétique avait un effet significatif (ANOVA, p < 0,05) sur la densité optique. L'essai a réussi à détecter les œufs de S. ocellatus dans des échantillons de terrain de la baie de Charleston (Caroline du Sud, États-Unis) et pourrait être incorporé aux pratiques de gestion actuelles ou adapté à d'autres espèces. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]