학술논문
RELATIONSHIP BETWEEN PEDIATRIC CELIAC DISEASE AND CHROMATIN REMODELING GENE EXPRESSIONS.
Document Type
Article
Source
Subject
*CELIAC disease
*GENE expression
*HLA histocompatibility antigens
*GLUTEN
*CHROMATIN
*GLIADINS
*HISTONE deacetylase
*
*
*
*
*
*
Language
ISSN
0534-0012
Abstract
Celijakija (CD) je imunološki zavisa sistemski poremećaj koji se javlja kod genetski predisponiranih osoba što rezultira oštećenjem tankog creva. Poznato je da je preoblikovanje hromatina, epigenetski mehanizam, povezan sa gastrointestinalnim bolestima povezanim sa hroničnom upalom. Međutim, nisu dostupne informacije o vezi između CD-a i pregradnje hromatina. U tu svrhu procenjeni su profili ekspresije gena grupe za preoblikovanje hromatina kod dece s dijagnozom CD-a prema Marsh-ovoj klasifikaciji i HLA-profilu i istražena je njihova povezanost s CD-om. U istraživanje su uključene endoskopske biopsije ugrađene u parafinski blok 40 dece sa CD dijagnozom i 30 zdrave dece. Pregledane su najčešće četiri mutacije (DQA1*05, DQB1*02, DQA1*03 i DQB1*03: 02) povezane sa CD-om na genu humanog leukocitnog antigena (HLA). Uzorci biopsije creva korišćeni su za izolaciju mRNA i sintezu cDNA. Ekspresije ukupno sedam gena u grupama za preoblikovanje hromatina (Kompleksna grupa SWI/SNF: ARID1A, Polycomb Group: CTBP1, Kompleksna grupa za nukleozomsko remodeliranje i histonska deacetilaze (NuRD): MTA1, Chromobox/Heterochromatin Protein 1 (HP1) Homolozi i Grupa CBX: CBX CBX7, Homeodomain (PHD) Proteinska grupa: NSD1, Porodična grupa inhibitora rasta (ING): ING 5) u studiji je analizirana pomoću qPCR u realnom vremenu. Analiza podataka izvršena je pomoću softvera proizvođača. Prekomerna ekspresija u genima ARID1A, CTBP1 i NSD1 otkrivena je kada se CD grupa upoređivala s kontrolnom grupom, ali nisu bile značajne (p=0,31, 0,33 i 0,33). CD grupi bez simptoma dijareje (atipično) utvrđena je statistički značajna nedovoljna ekspresija u genima CBX3 i CTBP1 (p=0,04 i p=0,004). Statistički značajna prekomerna ekspresija CTB1 otkrivena je u slučajevima Marsh 2 CD-a (p=0,03). U poređenju HLA DQ2/DQ8 pozitivne CD grupe bolesnika s kontrolnom grupom, NSD1, CBX3 i EED (p=0,75, 0,75 i 0,78) geni su bili prekomerno eksprimirani, a CBX7, MTA1, ARID1A i CTBP1genes (p=0,74, 0,75, 0,75 i 0,75) bili su nedovoljno izraženi. Ovo je prva studija koja je izvestila da ekspresija gena za preoblikovanje hromatina može imati ulogu u razvoju i napredovanju CD-a. Rezultati ove studije slučaja-kontrole otvoreni su za potvrdu u budućim studijama sa većim brojem ispitanika kako bi se dobili statistički značajni rezultati. [ABSTRACT FROM AUTHOR]