학술논문
Screening and analysis of differentially expressed genes from an alien addition line of wheat Thinopyrum intermedium induced by barley yellow dwarf virus infection.
Document Type
Article
Author
Source
Subject
*NUCLEIC acid hybridization
*POLYMERASE chain reaction
*POLYMERIZATION
*CHROMOSOMES
*CELL nuclei
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Language
ISSN
0831-2796
Abstract
La lignée d'addition TAI-27 contient une paire de chromosomes du Thinopyrum intermedium, laquelle porte un gène de résistance pour le virus de la jaunisse nanisante de l'orge (BYDV). Une banque soustractive a été produite à partir de feuilles de la lignée TAI-27, elles-mêmes infectées au stade trois feuilles par le Schizaphis graminum portant la souche GAV du BYDV ou un témoin. Neuf gènes exprimés différentiellement ont été identifiés parmi 100 clones choisis au hasard et séquencés. Deux des neuf gènes étaient très homologues à des gènes connus. Des sept autres clones d'ADNc, cinq montraient une homologie significative avec des séquences EST du blé ou de l'orge, tandis que les deux autres ne montraient aucune homologie. Cinq des neufs séquences exprimées différentiellement (WTJ9, WTJ11, WTJ15, WTJ19 et WTJ32) étaient très homologues (identité >94 %) avec des EST du blé ou de l'orge inoculés avec des pathogènes. Ces cinq séquences ainsi qu'une autre (WTJ18) étaient fortement homologues (identité >86 %) aussi à des EST induits par des stress abiotiques chez le blé ou l'orge. Des hybridations northern inversées ont montré que sept des neuf clones exprimés différentiellement hybridaient avec l'ADNc du T. intermedium infecté avec le BYDV. Trois de ceux-ci hybridaient également avec l'ADNc de la lignée 3B-2 (un des parents de la lignée TAI-27) infectée avec le BYDV. Le chromosome exotique présent chez TAI-27 a fait l'objet d'une microdissection. Les produits PCR issus d'une seconde ronde d'amplification avec un adaptateur ont été marqués à la dioxygénine et employés pour hybrider sur les neuf clones exprimés différentiellement. Cette analyse a montré que sept des gènes différentiellement exprimés étaient homologues à des séquences du chromosome exotique présent chez TAI-27. Ces séquences à expression différentielle pourraient servir d'EST pour le chromosome TAI-27. Cette recherche fournit des assises pour le criblage et le clonage de nouveaux gènes conférant la résistance au BYDV ou à d'autres pathogènes. [ABSTRACT FROM AUTHOR]