학술논문

β-Tubulin and histone H3 gene sequences distinguish Cryphonectria cubensis from South Africa, Asia, and South America.
Document Type
Article
Source
Canadian Journal of Botany. Jun2002, Vol. 80 Issue 6, p590-596. 7p.
Subject
*TUBULINS
*PROTEINS
*GENES
*MOLECULAR genetics
*HISTONES
Language
ISSN
0008-4026
Abstract
Cryphonectria cubensis (Bruner) Hodges is the causal agent of an important stem canker disease of Eucalyptus. Previous phylogenetic studies based on sequence data have shown that C. cubensis is distinct from other species of Cryphonectria but that C. cubensis isolates reside in two distinct groups, consistent with geographical origin. Thus, isolates of C. cubensis from South America and South Africa grouped together but apart from those originating from Southeast Asia and Australia. These results were in contrast with the symptoms of Cryphonectria canker in South Africa, which are different from those observed elsewhere in the world. The aim of this study was to use more variable regions of the fungal genome to test whether South African isolates of C. cubensis are genetically distinct from those from other parts of the world. For this comparison, β-tubulin and histone H3 gene sequences were used. Specimens from South America, Southeast Asia, Australia, and South Africa were also compared morphologically. The phylogram emerging from the analysis indicated that South American and Southeast Asian – Australian isolates resided in two well-resolved but closely related clades. However, isolates from South Africa were distinct from other groups. This is consistent with ecological aspects of the South African fungus, although no obvious morphological differences between the fungi from the various regions could be found. Our results suggest that the South African fungus represents a species distinct from C. cubensis occurring elsewhere in the world.Key words: β-tubulin, histone H3, molecular phylogeny, Cryphonectria cubensis.Le Cryphonectria cubensis (Bruner) Hodges est l'agent causal d'un important chancre de la tige chez les Eucalyptus. Des études phylogénétiques précédentes, basées sur les données de séquences, montrent que le C. cubensis se distingue de d'autres espèces de Cryphonectria mais que les isolats du C. cubensis forment deux groupes congrus avec les origines géographiques. Ainsi, les isolats du C. cubensis de l'Amérique du sud et de l'Afrique du sud se regroupent ensemble, mais distinctement des isolats provenant du sud-est asiatique et de l'Australie. Ces résultats contrastent avec les symptômes des chancres cryphonectriens de l'Afrique du sud, qui sont différents de ceux observés ailleurs dans le monde. Le but de cette étude était d'utiliser d'autres régions variables du génome fongique pour vérifier si les isolats de l'Afrique du sud du C. cubensis sont génétiquement distincts de ceux de d'autres parties du monde. Pour cette comparaison, les auteurs ont utilisé les séquences des gènes de la β-tubuline et de l'histone H3. Ils ont également comparé la morphologie de spécimens provenant de l'Amérique du sud, du sud-est asiatique, de l'Australie et de l'Afrique du sud. Le phylogramme résultant de ces analyses indique que les isolats provenant de l'Amérique du sud, du sud-est asiatique et de l'Australie se retrouvent dans deux clades distincts bien qu'étroitement reliés. Cependant, les isolats de l'Afrique du sud se distinguent des autres groupes. Ceci est congruent avec les aspects écologiques du champignon sud africain, bien qu'il n'y ait pas de différences morphologiques évidentes entre les champignons des diverses régions. Les résultats suggèrent que le champignon sud-africain constitue une espèce distincte du C. cubensis qu'on retrouve ailleurs dans le monde.Mots clés : β-tubuline, histone H3, phylogénie moléculaire, Cryphonectria cubensis.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]