부산대학교 도서관

Grâce à une approche basée sur la réaction en chaîne de la polymérase (PCR), nous avons examiné la diversité des gènes codant une polyketide synthase (PKS) présents dans 160 isolats fongiques marins représentants 142 espèces. Nous avons obtenu des produits PCR du domaine cétosynthase (CS) de 99 isolats fongiques représentant les Dothidéomycètes, les Sordariomycètes, les Eurotiomycètes et des formes incertae sedis. Les recherches de similarité de séquences et l’analyse phylogénique de 29 séquences partielles codant le domaine CS des organismes marins ont prédit des domaines codant des PKS réductrices, non-réductrices ainsi que des PKS de l’acide 6-méthylsalicilique. L’analyse bioinformatique des séquences alignées des domaines CS des champignons marins n’a révélé aucun motif unique dans cette région. Cependant, plusieurs positions déterminant la spécificité sont apparentes au sein des PKS fongiques du 6-méthylsalicilique, comparativement aux PKS réductrices ou non-réductrices. L’évaluation de ces positions dans le contexte d’un modèle structural en 3-D de la protéine met en évidence leur utilité potentielle comme marqueurs de classification des PKS. L’évaluation des sites de liaison des amorces est essentielle pour obtenir des fragments du domaine CS de PKS présumées, tout en maintenant un niveau adéquat d’information de séquence pour les classer et les caractériser de façon appropriée. [ABSTRACT FROM AUTHOR]