부산대학교 도서관

Comme le génotypage par séquençage (GBS) est largement utilisé pour les analyses génétiques chez l'orge, la correspondance entre la position physique des marqueurs SNP dérivés du GBS et leur position génétique précise est importante à établir. Le but principal de ce travail était de produire une carte génétique consensus à haute résolution fondée sur des marqueurs SNP dérivés du GBS. La production de cette carte intégrée repose sur 11 populations biparentales totalisant 3743 individus en ségrégation. Les auteurs ont employé une série de paramètres uniformes pour l'appel et la filtration des SNP ce qui a permis d'identifier 50 875 marqueurs distincts qui étaient en ségrégation au sein d'au moins une population. Ces SNP ont ensuite été groupés en 18 580 SNP non-redondants (« bins »). La carte génétique consensus ainsi produite s'étend sur 1050,1 cM, offrant ainsi une densité moyenne de 17,7 bins et 48,4 SNP par cM. La carte consensus ne présente aucun grand intervalle dépourvu de marqueurs (« gaps » significatifs), l'intervalle le plus grand entre bins étant de seulement 3,7 cM et la distance moyenne entre bins étant de 0,06 cM. Cette carte à haute résolution trouvera de nombreuses applications en génomique tel que des informations utiles sur le niveau de recombinaison à proximité de QTL/gènes identifiés au terme d'analyses GWAS ou pour assurer une distribution uniforme des marqueurs SNP lors du développement d'outils de génotypage à faible coût reposant sur un nombre limité de marqueurs. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]