학술논문

Genetic diversity of Plasmodium falciparum merozoite surface protein-1 (block 2), glutamate-rich protein and sexual stage antigen Pfs25 from Chandigarh, North India.
Document Type
Journal Article
Source
Tropical Medicine & International Health. Dec2017, Vol. 22 Issue 12, p1590-1598. 9p.
Subject
*PLASMODIUM falciparum
*MEROZOITES
*MEDICAL genetics
*PROTEINS
*ANTIGENS
*DNA analysis
*ALLELES
*BIOLOGICAL evolution
*GENES
*GENETIC polymorphisms
*GLUTAMIC acid
*MALARIA
*PROTOZOA
*GENOTYPES
Language
ISSN
1360-2276
Abstract
Objectif Elucider la diversité génétique de P. falciparum dans les foyers résiduels de transmission du nord de l'Inde. Méthodes Les patients cliniquement soupçonnés du paludisme ont subi un dépistage par la microscopie pour l'infection par le paludisme. 48 patients infectés par P. falciparum ont été recrutés dans deux hôpitaux de soins tertiaires à Chandigarh, en Inde. Des échantillons de sang ont été prélevés chez les patients recrutés, l'extraction de l' ADN génomique et la PCR nichée ont été réalisées pour confirmation de l'espèce. Le séquençage de Sanger a été réalisé en utilisant des amorces spécifiques de la région block 2 de msp1, la région R2 de glurp et pfs25. Résultats Une diversité étendue a été trouvée dans msp1 avec majoritairement les allèles RO33. Globalement la prévalence allélique était de 56% pour RO33, 39% pour MAD20 et 5% pour K1. Six variantes ont été observées pour MAD20, alors qu'aucune variante n'a été trouvée dans les allèles RO33 et K1. Une analyse phylogénétique des allèles RO33 a indiqué plus de similarité avec les isolats d'Afrique du Sud, alors que les allèles MAD20 ont montré une similarité avec les isolats d'Asie du Sud-Est. Dans glurp, une grande variabilité a été observée avec onze allèles différents sur base des repeats AAU. Cependant, pfs25 a montré moins de diversité et était le plus stable parmi les gènes ciblés. Conclusion Nos résultats documentent la diversité génétique parmi les souches circulantes de P. falciparum dans une région de l'Inde avec une faible transmission du paludisme et pourraient avoir des implications sur les stratégies de lutte pour atteindre l'objectif national d'élimination du paludisme. [ABSTRACT FROM AUTHOR]