학술논문
Sui Generis Development of Molecular Markers from Transcriptome of Crotalaria juncea, a Fabaceae Family Bast Fiber Crop.
Document Type
Article
Author
Source
Subject
*BRASSICA juncea
*MICROSATELLITE repeats
*SINGLE nucleotide polymorphisms
*TRANSCRIPTOMES
*LEGUMES
*GENETIC distance
*FIBERS
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Language
ISSN
1544-0478
Abstract
阳光大麻（Crotalaria juncea L.）是一种豆科韧皮纤维作物, 缺乏基因组资 源是种质鉴定和遗传分析的主要制约因素之一. 我们从太阳大麻的新花蕾 转录组中鉴定了多种分子标记的非冗余组. 这些分子标记包括1683个简单 序列重复、4759个主要来自蛋白质编码基因的内含子长度多态性标记和 3309个单核苷酸多态性等位基因特异性标记. 所有这些标记资源都已集成 到一个简单的数据库中, 便于访问. 为了评估所选引物的标记效率和多态性 信息含量, 在阳光大麻种质资源中验证了SSR和内含子长度多态性标记的子 集, 以获得0.26–0.32的平均PIC值. SSR基因分型图谱也有助于基于遗传距离 矩阵的向日葵种质资源聚类. 这些分子标记在跨属韧皮纤维作物中成功扩 增的能力进一步证明了它们在基因分型中的有效性. 因此, 本研究描述了之 前未公开的向日葵内源分子标记的鉴定, 这些标记在向日葵的遗传研究和 育种中具有潜在的应用价值, 以改善韧皮纤维. [ABSTRACT FROM AUTHOR]