학술논문
Uncovering the magnitude of African pangolin poaching with extensive nanopore DNA genotyping of seized scales.
Document Type
Article
Author
Yeo, Darren; Chan, Amy H. J.; Hiong, Kum Chew; Ong, Jasmine; Ng, Jun Yuan; Lim, Jie Min; Zhang, Wendy; Lim, Sara R.; Fernandez, Charlene J.; Wong, Anna M‐S.; Lee, Benjamin P. Y‐H.; Khoo, Max D. Y.; Cheng, Thaddaeus X. W.; Lim, Bryan T. M.; Yeo, Hazelina H. T.; Tan, Maxine M. Q.; Sng, Wendy B. G.; Adam, Shaun S.; Ang, Wee Foong; How, Choon Beng
Source
Subject
*GENETIC testing
*POACHING
*DNA
*CYTOCHROME b
*HAPLOTYPES
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Language
ISSN
0888-8892
Abstract
Revelación de la magnitud de la caza furtiva del pangolín africano mediante el genotipo extenso de nanoporos de ADN de escamas incautadas Resumen: Aunque el mercado de pangolines es ilegal, se incautan toneladas de sus escamas y productos derivados en varios puertos comerciales. Es un reto procesar estas magnas incautaciones y obtener el genotipo completo para usarlo en la trazabilidad logística ascendente e identificación de la especie y así imponer sanciones. Implementamos una canalización escalable del código de barras de ADN en el cual usamos la extracción rápida de ADN y la secuenciación MinION para obtener el genotipo de una proporción sustancial de las escamas de pangolín submuestreadas en dos cargamentos incautados en 2019 en Singapur (37.5 t). Usamos secuencias referenciales para emparejar las escamas con las regiones filogeográficas de origen. Identificamos en total 2,346 códigos de citocromo b (cytb) del pangolín de vientre blanco (Phataginus tricuspis) (de 1,091 escamas), de vientre negro (P. tetradactyla) (227 escamas) y del pangolín gigante (Smutsia gigantea) (1,028 escamas). La diversidad de haplotipos fue mayor en las escamas de P. tricuspis (121 haplotipos, 66 nuevos) que en las de P. tetradactyla (22 haplotipos, 15 nuevos) y S. gigantea (25 haplotipos, 21 nuevos). De los haplotipos nuevos, el 74.2% probablemente provenía del occidente y centro‐occidente de África, lo que sugiere un resurgimiento potencial de la caza furtiva y poblaciones recién explotadas en estas regiones. Nuestros resultados demuestran la utilidad de submuestrear extensivamente las grandes incautaciones y esboza una estrategia molecular eficiente para un análisis genético rápido que debería ser accesible para la mayoría de los laboratorios forenses y las autoridades de aplicación. [ABSTRACT FROM AUTHOR]