부산대학교 도서관

En raison d'infections fongiques nouvelles ou émergentes, les champignons pathogènes humains et animaux constituent une menace croissante mondialement. Les outils diagnostiques actuels sont lents, non-discriminants au niveau spécifique ou sous-spécifique, et ils nécessitent une expertise morphologique pour identifier avec justesse les agents pathogènes en cultures pures. Les codes à barres de l'ADN sont des séquences d'ADN courtes, spécifiques, faciles à amplifier et universelles, ce qui rend possible une identification rapide par simple comparaison avec une collection de séquences de référence bien constituée. Le principal code à barres de l'ADN chez les champignons est la région ITS, laquelle a été employée initialement en 2012 et est maintenant employée de manière routinière dans les laboratoires diagnostiques. Cependant, la région ITS ne permet d'identifier avec justesse qu'environ 75 % de tous les spécimens fongiques d'intérêt médical, ce qui a créé la nécessité de développer un code à barres secondaire de manière à augmenter la résolution et la pertinence du codage à barres de l'ADN pour le diagnostic des maladies fongiques. Le facteur d'élongation de la traduction 1α (TEF1α) a été choisi en 2015 comme code à barres secondaire chez les champignons, mais n'a pas été tellement employé en raison de l'absence d'une base de données de séquences de référence. Dans ce travail, les auteurs ont établi une telle base de référence dont la qualité a été vérifiée pour le code à barres secondaire qui, conjointement à la base de données ISHAM-ITS, forme la base de données « ISHAM barcode database », disponible en ligne à http://its.mycologylab.org/. Les auteurs encouragent la communauté des mycologues à y contribuer activement. L'utilisation d'un système de codage à barres double facilitera l'identification juste de tous les champignons pathogènes d'intérêt clinique. [ABSTRACT FROM AUTHOR]