학술논문

Genome size variation in Corchorus olitorius (Malvaceae s.l.) and its correlation with elevation and phenotypic traits.
Document Type
Article
Source
Genome. Jul2011, Vol. 54 Issue 7, p575-585. 11p.
Subject
*TOSSA jute
*PHENOTYPES
*BIOLOGICAL variation
*PLANT genetics
*NUCLEOTIDE sequence
*FLOW cytometry
*DNA
Language
ISSN
0831-2796
Abstract
Dans ce travail, les auteurs rapportent des mesures de la taille du génome chez le Corchorus olitorius (Malvaceae s.l.), une espèce cultivée connue pour sa plasticité morphologique et vaste distribution géographique, ainsi que chez le C. capsularis, la seconde espèce la plus cultivée au sein de ce genre. Des analyses de cytométrie en flux ont été réalisées sur plusieurs tissus et avec divers tampons d'isolement de noyaux chez 69 accessions du C. olitorius et 4 accessions du C. capsularis représentant divers habitats et origines géographiques. Le contenu 2C moyen en ADN nucléaire (± écart-type) a été estimé à 0,918 ± 0,011 pg pour le C. olitorius, avec un minimum de 0,882 ± 0,004 pg et un maximum de 0,942 ± 0,004 pg. Tous les matériels végétaux examinés étaient diploïdes avec 2 n = 14. La taille du génome était corrélée négativement avec le nombre de jours jusqu'à la floraison ( r = -0,29, p < 0,05) et positivement avec la surface de la graine ( r = 0,38, p < 0,05). De plus, une corrélation positive statistiquement significative a été détectée entre la taille du génome et l'altitude ( r = 0,59, p < 0,001) chez les populations sauvages. La teneur moyenne 2C de L'ADN nucléaire du C. capsularis a été évaluée à 0,802 ± 0,008 pg. Comparées à d'autres espèces cultivées d'importance économique, les tailles des génomes du C. olitorius et du C. capsularis sont très petites et comparables à celle du riz. La taille relativement petite de ces génomes constituera un avantage général pour tout effort en génomique ou en matière de séquençage chez ces espèces. [ABSTRACT FROM AUTHOR]