학술논문
Use of diversity arrays technology markers for integration into a cotton reference map and anchoring to a recombinant inbred line map.
Document Type
Article
Author
Source
Subject
*NUCLEOTIDE sequence
*GENETIC markers
*GENE mapping
*GENETIC polymorphisms
*AMPLIFIED fragment length polymorphism
*ARABIDOPSIS
COTTON genetics
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Language
ISSN
0831-2796
Abstract
Une plate-forme de génotypage DArT a été développée pour le génome du cotonnier de manière à comparer les marqueurs DArT aux marqueurs AFLP en matière de cartographie et de transportabilité des marqueurs d'une population à une autre. Les auteurs ont employé une carte génétique de référence pour le Gossypium L. tétraploïde qui comptait déjà environ 5,000 locus, groupés en 26 chromosomes, pour y ajouter les marqueurs DArT et AFLP nouvellement développés en vue d'améliorer l'utilité et la résolution de cette carte. Les résultats obtenus ont montré que la proportion des marqueurs DArT qu'ils étaient en mesure de placer sur la carte (78,15 %) était beaucoup plus élevée que pour les marqueurs AFLP (22,28 %). L'analyse de la séquence des marqueurs DArT a révélé que la majorité d'entre eux étaient homologues à des séquences d'EST rapportées chez des espèces tétraploïdes ou diploïdes du Gossypium. Au total, 794 gènes d'Arabidopsis étaient homologues à une séquence de marqueur DArT. Les chromosomes 5(A), 7(A), 19 (D), 23(D) et 24(D) portaient davantage de marqueurs DArT synténiques avec le génome d'Arabidopsis que les autres chromosomes. L'ancrage des marqueurs DArT de la carte de référence sur une carte de lignées RIL a permis de constater que ces marqueurs permettent d'accélérer la production de cartes pour de nouvelles populations de lignées RIL. [ABSTRACT FROM AUTHOR]