학술논문

Construction of a reference linkage map for melon.
Document Type
Article
Source
Genome. Oct2001, Vol. 44 Issue 5, p836-845. 10p.
Subject
*MUSKMELON
*PLANT genetics
*GENETIC markers
*GENE mapping
*PLANT isozymes
*GENE libraries
Language
ISSN
0831-2796
Abstract
A map of melon (Cucumis melo L.) with 411 markers (234 RFLPs, 94 AFLPs, 47 RAPDs, 29 SSRs, five inter-SSRs, and two isozymes) and one morphological trait (carpel number) was constructed using the F[sub 2] progeny of a cross between the Korean accession PI161375 and the Spanish melon type 'Pinyonet Piel de Sapo'. RFLPs were obtained using 212 probes from different genomic and cDNA melon libraries, including 16 Arabidopsis ESTs, 13 Cucumis known genes, and three resistant gene homologues. Most loci (391) mapped to 12 major linkage groups, spanning a total genetic distance of 1197 cM, with an average map interval of 3 cM/marker. The remaining 21 loci (six RAPDs and 15 AFLPs) were not linked. A majority (66%) of the markers were codominant (RFLPs, SSRs, and isozymes), making them easily transferable to other melon crosses. Such markers can be used as a reference, to merge other melon and cucumber maps already constructed. Indeed, some of them (23 SSRs, 14 RFLPs, one isozyme, and one morphological trait) could act as anchor points with other published cucurbit maps.Key words: Cucumis melo, genetic map, molecular markers, RFLPs, SSRs.Une carte génétique du melon (Cucumis melo L.) composé de 411 marqueurs (234 RFLP, 94 AFLP, 47 RAPD, cinq inter-SSR et deux isoenzymes) et un caractère morphologique (nombre de carpelles) a été produite à partir de la progéniture F[sub 2] d'un croisement entre une accession coréenne, PI161375, et un melon de type espagnol 'Pinyonet Piel de Sapo'. Les marqueurs RFLP ont été obtenus à l'aide de 212 sondes issues de diverses banques génomiques ou d'ADNc du melon, de même que 16 EST d'Arabidopsis, 13 gènes connus chez Cucumis et trois homologues de gènes de résistance. La majorité des locus (391) ont pu être assignés à l'un de 12 groupes de liaison principaux qui totalisaient 1197 cM et présentaient une distance moyenne de 3 cM entre les marqueurs. Les 21 marqueurs restants (six RAPD et 15 AFLP) n'étaient pas liés. La majorité des marqueurs (66%) étaient de type codominant (RFLP, microsatellites et isoenzymes) ce qui permet aisément de les employer sur des populations issues de d'autres croisements. De tels marqueurs peuvent être employés comme points de référence dans le but d'intégrer des cartes génétiques du melon ou du concombre produites antérieurement. En effet, certains de ces marqueurs (23 microsatellites, 14 RFLP, une isoenzyme et un caractère morphologique) pourraient servir de points d'ancrage avec les autres cartes génétiques chez les cucurbitacées.Mots clés : Cucumis melo, carte génétique, marqueurs moléculaires, RFLP, microsatellites.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]