부산대학교 도서관

DNA mikroarrayleri, aynı anda binlerce gen ve bunlara ait ifade seviyelerinin kantitatif analizlerine izin vermektedir. Bu çalışmada, hassas arpa (Hordeum vulgare L.) çeşidi Hamidiye yaprak dokularında bor (B) toksisitesi ile ilgili transkriptom değişiklikleri Barley1 GeneChip kullanılarak araştırılmıştır. Aseptik koşullarda büyütülmüş 8 günlük bitkilere 5 gün boyunca 5 ya da 10 mM borik asit (B(OH)3) uygulanmış ve DNA mikroarrayleri ile yaprak dokusunda gen ifade profilleri belirlenmiştir. GeneChip üzerinde herbiri bir prob seti ile temsil edilen 22.840 transkriptten 19.424'ü, en az bir hibridizasyonda, tüm sinyal değerlerinin % 20'lik en düşük diliminden daha yüksek sinyal vermiştir. Kontrol (10 μM B(OH)3) ile karşılaştırıldığında, 5 mM B(OH)3 uygulaması 168 genin ifade seviyelerinde en az 2 kat farklılığa neden olmuştur. Ayrıca 10 mM B(OH)3 uygulaması 312 genin ifade seviyelerinde en az 2 kat artış ya da azalış ile sonuçlanmıştır. 5 ve 10 mM B(OH)3 uygulaması altında bu genler arasından sırası ile 37 ve 61 gene ait ifade seviyeleri anlamlı (P < 0.05) farklılıklar göstermiştir. İfadesi farklılık göstermiş genler gen ifadelerine dayalı kümeleme ve HarvEST:Barley ile tanımlanmıştır. İfade profillerinin incelenmesi ile, B toksisitesinin arpa transkriptomunda ve sinyal ya da moleküler tepki ağlarında geniş çaplı değişikliklere neden olduğu ortaya konmuştur. Toksisiteye tepkinin önemli bir özelliği çeşitli çevresel streslere tepki ilebağlantılı olmasıdır. Buna ek olarak jasmonik asit ile ilgili genlerin ifadelerindeki artışın B toksisitesine önemli bir geç tepki olduğu bulunmuştur. Bor stresi altında arpanın genel gen ifade analizi üzerine ilk araştırma olan bu çalışma, bor toksisitesinin moleküler mekanizmalarını açıklamayı amaçlayan sonraki çalışmalara ışık tutacaktır. [ABSTRACT FROM AUTHOR]