학술논문

1900'LÜ YILLARA AİT DİŞ TAŞI ÖRNEĞİNDE MOLEKÜLER BAKTERİ ANALİZLERİ İLE BESLENME VE HASTALIK DURUMLARININ İRDELENMESİ.
Document Type
Article
Source
Nobel Medicus Journal. Sep/Dec2022, Vol. 18 Issue 3, p178-186. 9p.
Subject
*DENTAL calculus
*BACTERIAL DNA
*ALUMINUM foil
*RALSTONIA
*SODIUM hypochlorite
*DECONTAMINATION of food
*ELEMENTAL diet
*BLEACHING (Chemistry)
*DO-not-resuscitate orders
Language
Turkish
ISSN
1305-2381
Abstract
Amaç: Tepeköy Höyük kurtarma kazıları Muş ili ile Varto ilçesi yakınlarında Tepeköy köyünde gerçekleşmiştir. Bu bölgeye ait dört kafatasındaki tarihi diş taşlarından örnek alınmasına rağmen sadece bir bireyde DNA analizi yapılabilmiş ve buna göre bu bireyin maruz kaldığı bakterilere bağlı fizyolojik özellikleri ve hastalıkları konusunda tahminde bulunabilmiştir. Materyal ve Metot: Çalışmanın gerçekleştiği bireyin 20-35 yaş aralığında öldüğü, 151-162 cm arasında bir boya sahip olduğu, omurlannda hafif derecede kemik osteofitleri bulunduğu gözlenmiştir. Bireyin diş taşı örneği temiz alüminyum folyo üzerine toplandı. Daha sonra steril vidalı tüpe aktanldı. Numune dekontaminasyonu için UV ışınlaması, dış yüzeyin temizliği ve dekontaminasyonu için ağartıcı işlem kullanıldı (%4 ağartıcı, sodyum hipoklorit, NaClO), steril bir kapta (petri kabı) beş dakikaya kadar havada kurumaya bırakıldı. Numune toz haline getirildikten sonra, steril bir vidalı kapaklı tüpe döküldü. MagPurix Bacterial DNA Extraction Kit kullanılarak, MagPurix (Zinexts, Taiwan) cihazında izolasyon işlemi yapıldı. Buna göre çalışmak için getirilen dört örnekten sadece birinde DNA elde edildi. 16S r-RNA izolasyonu ve Nanopore Dizi Analizi için Oxford Nanopore Teknolojisi (England) kullanıldı. Daha sonra bioinformatik analiz ile cins düzeyine kadar bakteri analizi yapıldı. Bulgular: Bakteri şube düzeyinden cins düzeyine kadar sınıflandınlmış ve bu sınıflarda ilk sırayı şu bakteriler almıştır. Şube düzeyinde; Firmicutes %52,74, sınıf düzeyinde; Clostridia %31,55, takım düzeyinde; Clostridiales %31,55, aile düzeyinde; Ruminococcaceae %24,29, tür düzeyinde; Ralstonia %21,48, ilk sırayı almışlardır. Sonuç: Elde edilen bakteriler aracılığı ile bu bireyin fizyolojik özellikleri ve hastalıklan konusunda bağlantılı kurulmuş olup bu kişin obez, diabete eğimli ve özellikle beslenme şekli olarak tahılla beslendiği öngörüsünde bulunulmuştur. [ABSTRACT FROM AUTHOR]