학술논문

Patterns of genomic diversification reflect differences in life history and reproductive biology between figs ( Ficus) and the stone oaks ( Lithocarpus).
Document Type
Article
Source
Genome. 2017, Vol. 60 Issue 9, p756-761. 6p.
Subject
*FIG
*LITHOCARPUS
*FAGACEAE
*MORACEAE
*FICUS (Plants)
*BIODIVERSITY
*COMPARATIVE genomics
Language
ISSN
0831-2796
Abstract
Un des aspects remarquables de la formidable biodiversité rencontrée dans les forêts tropicales est la grande gamme de stratégies évolutives ayant donné naissance à cette diversité, chose qui indique l'existence de nombreuses voies menant à la diversification. Les auteurs comparent deux groupes d'arbres diversifiés dont les biologies diffèrent de manière marquée pour déterminer si ces différences se reflètent dans leurs génomes. Le genre Ficus (Moracées), avec sa complexe relation co-évolutive avec des guêpes pollinisatrices obligatoires, produit de très nombreuses petites graines qui sont largement dispersées. Le genre Lithocarpus (Fagacées), lequel profite d'une pollinisation par des insectes généralistes, produit de grosses graines qui sont peu dispersées. Les auteurs explorent l'hypothèse que ces différentes biologies reproductives et stratégies de cycle de vie devraient avoir un impact profond sur les propriétés de base de la divergence des génomes au sein de chaque genre. En faisant appel à un séquençage peu profond chez six espèces de Ficus, sept espèces de Lithocarpus et trois exo-groupes, les auteurs ont mesuré la diversité génomique globale, la diversité partagée au sein des espèces de chaque genre, ainsi que la fraction de cette diversité partagée qui concorde avec les grandes divisions phylogénétiques. Une fraction du génome substantiellement plus grande est commune aux différentes espèces du genre Lithocarpus et une part importante de cette diversité partagée ne concordait pas avec l'historique évolutif général de ces génomes. De plus, chaque espèce de figuier présentait une fraction plus grande de diversité unique que ce qui a été rencontré chez le genre Lithocarpus. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]