학술논문

Genetic diversity and phylogenetic relationships of threadfin breams (Nemipterus spp.) from the Red Sea and eastern Mediterranean Sea.
Document Type
Article
Source
Genome. 2021, Vol. 64 Issue 3, p207-216. 10p.
Subject
*CYTOCHROME oxidase
*SEBASTES marinus
*HAPLOTYPES
POPULATION of China
Language
ISSN
0831-2796
Abstract
Dans le présent travail, les auteurs ont employé des séquences partielles du gène de la sous-unité I de la cytochrome c oxydase (COI) pour étudier des populations de cohanas (Nemipteridés) de la mer Rouge (Nemipterus randalli seulement) et du bassin Indo-Pacifique. Un arbre de vraisemblance maximale a permis de séparer quatre espèces — N. randalli , N. japonicus , N. bipunctatus et N. zysron — en quatre clades. Une analyse des haplotypes a révélé des évidences fortes en faveur d'un effet fondateur pour le migrant lessepsien N. randalli : trois haplotypes ont été rencontrés pour l'ensemble des régions échantillonnées dans la Méditerranée et un seul haplotype était partagé avec un individu de la mer Rouge, ce qui suggère que la population colonisatrice a été fondée par un faible nombre de migrants. La population du N. japonicus de la mer Rouge partageait des haplotypes avec les populations du golfe Persique et de l'océan Indien, tandis que les populations de la mer de Chine méridionale étaient complètement isolées. Les réseaux d'haplotypes chez le N. randalli et le N. bipunctatus ont également révélé des haplotypes en commun entre les populations de la mer Rouge et de l'océan Indien. Chez le N. zysron , un haplotype était partagé entre individus de l'Indonésie et du golfe Persique. Les auteurs discutent de l'impact de la perpétuation de l'utilisation de séquences contenues dans des bases de données publiques qui sont rattachées à des organismes initialement mal identifiés et fournissent des recommandations pour éviter la distribution de séquences associées à des noms scientifiques erronés. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]