학술논문
X 连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系TRAPPC2 基因缺失 突变的高通量测序分析.
Document Type
Article
Source
Subject
Language
Chinese
ISSN
1674-8115
Abstract
目的·研究一个X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良（spondyloepiphyseal dysplasia tarda, SEDT） 家系的致病基因及突 变类型。方法·提取一个SEDT 家系6 名成员外周血基因组DNA。应用Clearseq 遗传性疾病试剂盒靶向捕获先证者基因组 样本中与罕见遗传性疾病相关的致病区域, 并进行高通量测序, 过滤去除高频突变。采用外显子组隐马尔科夫模型 （exome hidden Markov model, XHMM） 分析拷贝数变异（copy number variant, CNV）, 并进一步对6 名家系成员基因缺失 片段的拷贝数进行实时定量PCR分析。结果·高通量测序分析结果显示, 先证者X染色体存在2.5 kb缺失（chrX：13 732 385~ 13 734 927）, 该区域覆盖转运蛋白复合体亚单位2 （transport protein particle complex subunit 2, TRAPPC2） 基因的第4~6 个 外显子。定量PCR结果证实先证者及其表哥均存在该缺失, 先证者母亲为杂合缺失, 先证者父亲、姐姐和表型正常的舅舅 拷贝数均正常。结论·TRAPPC2 基因第4~6 个外显子片段的缺失为SEDT 的致病性突变;同时高通量测序分析中运用 XHMM算法可检测到致病基因多个外显子的缺失. [ABSTRACT FROM AUTHOR]