학술논문
黄瓜 DnaJ 基因家族鉴定及对高温胁迫的表达响应.
Document Type
Article
Source
Subject
*ARABIDOPSIS proteins
*TANDEM repeats
*AMINO acid sequence
*HIGH temperatures
*CHROMOSOMES
*GENES
*GENE families
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Language
Chinese
ISSN
1000-2030
Abstract
:[目的]本文旨在研究黄瓜热激蛋白DnaJ (CsDnaJ) 的家族基因鉴定, 并分析其在高温胁迫环境下的响应模式. [方 法]利用生物信息学软件及黄瓜的全基因组测序数据库、公共数据库对 CsDnaJ 进行基因家族成员、染色体位置、蛋白特 性、结构特征、进化及复制模式和组织表达特性分析, 同时通过实时定量 PCR 技术分析其在高温胁迫环境下的响应模式. [结果]黄瓜 CsDnaJ 基因家族共存在81 个成员基因, 其中 Chr 3 含 DnaJ 基因最多, 为16 个, Chr 4、Chr 7 最少, 均为９ 个ꎻ CsDnaJ 基因所编码的蛋白序列长度为113~2551 aa, 且至少含有１ 个完整的Ｊ 结构域核心区序列ꎻ亚细胞位置预测显示大 部分蛋白定位于细胞核及叶绿体中. 基因结构显示 CsDnaJ 基因均含有１~22 个外显子. 通过进化分析发现 CsDnaJ 蛋白 可明显区分为９ 个亚簇, 每个亚簇均存在拟南芥同源蛋白. 共线性分析发现, CsDnaJ 基因家族共存在17 个共线基因, 组成 10 对复制基因对, 其中存在５ 对片段重复事件, ３ 对串联重复事件, ２ 对随机重复事件. 组织表达特异性结果显示 CsDnaJ 基因在叶、茎、子房中的表达量略高于其在雄花、雌花、根及卷须中的表达量. 荧光定量 PCR 结果显示, 高温环境(昼/ 夜温 度为42 ℃ /35 ℃)可以诱导 CsDnaJ 基因的高表达, 从而参与植物响应高温环境胁迫进程. [结论]黄瓜 CsDnaJ 基因家族 核心结构域高度保守, 在黄瓜响应高温胁迫中发挥重要作用. [ABSTRACT FROM AUTHOR]