학술논문
陆地棉PUP 家族基因的鉴定及表达分析.
Document Type
Article
Source
Subject
*LOCUS (Genetics)
*PROMOTERS (Genetics)
*GENE families
*PLANT growth
*PLANT development
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Language
Chinese
ISSN
1002-2481
Abstract
为了有助于开展陆地棉PUP 家族基因的生物学功能研究，也为后续陆地棉PUP 基因在抗逆中功能的研 究提供候选基因，利用生物信息学从陆地棉中鉴定PUP 基因，并对PUP 基因结构、保守结构域、顺式作用元件以 及在胁迫条件下的表达等进行分析。结果表明，从陆地棉（TM-1）中共鉴定出31 个PUP 基因，依据进化分析结 果，将这些基因分为3 个亚支。染色体定位及基因复制事件分析结果表明，31 个GhPUP 家族基因分布在19 条染 色体上，且所有的PUP 基因都由基因复制事件产生，复制类型为片段重复；基因结构的分析结果显示，陆地棉 PUP 基因大多数只有1 个内含子，少数有2 个或3 个内含子，也有少数基因没有内含子；保守结构域分析表明，不 同亚支上的PUP 蛋白既有共同性也有特异性。顺式作用元件分析结果显示，GhPUPs 基因启动子区域共有18 个 元件，这些元件分属于激素应答、胁迫/物理应答以及植物生长发育相关元件3 类。同时，结合进化分析和转录组 数据，筛选出了参与陆地棉胁迫应答的PUP 基因。 [ABSTRACT FROM AUTHOR]