학술논문
基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-人参药对治疗胃癌的作用机制 / Mechanism of astragalus-ginseng herb pair in the treatment of gastric cancer based on network pharmacology and molecular docking
Document Type
Academic Journal
Author
黄洪; 张燕; 张志娜; 张宁; 吴志斌; 王定雪; 王镜辉; 叶涛; HUANG Hong; ZHANG Yan; ZHANG Zhina; ZHANG Ning; WU Zhibin; WANG Dingxue; WANG Jinghui; YE Tao
Source
癌症进展 / Oncology Progress. 20(22):2289-2294
Subject
Language
Chinese
ISSN
1672-1535
Abstract
目的 基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-人参药对治疗胃癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、DisGeNET数据库提取黄芪、人参和胃癌的靶点,取交集后获得相互作用靶点.采用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析,筛选出核心靶点蛋白.通过R语言进行基因本位(GO)注释富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.运用Cytoscape 3.7.1软件构建黄芪-人参药对的药物-有效活性成分-靶点-疾病网络可视图,将得到的核心靶点和药物有效成分导入AutoDock Vina和Pymol软件进行蛋白质-配体间相互作用的分子对接.结果 黄芪-人参药对有效成分的作用靶点141个,导入String网站,构建黄芪-人参药对靶标的PPI网络图,筛选得到靠前的10个靶点蛋白,分别为雄激素受体(AR)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、促分裂原活化的蛋白激酶1(MAPK1)、RB转录辅抑制因子1(RB1)、雌激素受体1(ESR1)、核因子受体辅激活蛋白1(NCOA1)、p65、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2).分子对接结果显示,6大有效核心成分与前10个核心靶点具有广泛的结合活性,其中AR-山奈酚、HSP90AA1-芒柄花素、MAPK1-人参皂苷Rh2、RB1-山奈酚、ESR1-山奈酚、NCOA1-槲皮素、RELA-异鼠李素、AKT1-毛蕊花素、EGFR-毛蕊花素、Bcl-2-山奈酚间的结合活性最显著.结论 黄芪-人参药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗胃癌,为后期黄芪-人参药对抗肿瘤作用机制研究及实验验证奠定了基础.