학술논문
3个中国遗传性对称性色素异常症家系ADAR基因新变异的鉴定 / Identification of the pathogenic variants in three Chinese families with dyschromatosis symmetrica hereditaria
Document Type
Academic Journal
Author
Source
基础医学与临床 / Basic & Clinical Medicine. 43(2):259-264
Subject
Language
Chinese
ISSN
1001-6325
Abstract
目的 对3个中国遗传性对称性色素异常症(DSH)家系进行临床特征分析及致病变异鉴定.方法 收集3个中国DSH患者及其家系成员的临床资料并采集外周血,应用全外显子组测序技术(WES)对3个DSH家系的先证者进行变异筛查,并使用Sanger测序技术进行家系基因型-表型共分离验证,最后通过系列生物信息分析软件对新发现变异的致病性进行预测.结果 3个中国DSH家系的先证者均表现为肢端色素沉着减少斑间杂色素沉着过度斑.WES结果发现3个先证者均携带ADAR基因(NM 001111.5)变异,先证者1携带ADAR基因c.3546T>G(p.Tyr1182?)无义变异,先证者2携带ADAR基因c.2770T>G(p.Tyr924Asp)错义变异,先证者3携带ADAR基因c.3116A>C(p.Lys1039Thr)错义变异.前两个变异均未在gnomAD和HGMD等公共数据库中收录,第三个变异在HGMD数据库中收录,人群频率为0.Sanger测序结果表明这3个家系中先证者的父母均未携带相应变异,提示这3个变异均为新发变异.这3个变异位点在不同物种中高度保守,且均位于双链RNA特异性腺苷脱氨酶蛋白的腺苷脱氨酶催化结构域.根据美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)指南,ADAR基因c.3546T>G无义变异被判定为致病(PVS1+PS2+PM2+PP3+PP4),c.2770T>G、c.3116A>C错义变异被判定为致病(PS2+PM1+PM2+PP3+PP4)以及(PS1+PS2+PM1+PM2+PP3+PP4).结论 ADAR基因的新发变异c.3546T>G、c.2770T>G和c.3116A>C可能分别是这3个中国DSH患者的发病原因,以上结果丰富了ADAR基因的突变谱.