부산대학교 도서관

Cette étude s'est penchée sur la structure phylogénétique d'isolats d' Haemophilus influenzae de sérotype a (Hia) prélevés de patients au Canada. Les isolats d'Hia de 490 patients distincts et une souche de l'ATCC (« American Type Culture Collection ») ont été analysés par typage génomique multilocus (MLST) avec 18 types de séquences (ST) différents identifiés. La plupart des isolats d'Hia prélevés des patients (85,7 %) appartenaient au ST-23 alors que 12,7 % appartenaient à 14 ST différents, avec six, cinq ou quatre locus géniques en MLST reliés au ST-23 (complexe ST-23). La phylogénie de la variation mononucléotidique (SNVPhyl, « single-nucleotide variation phylogeny ») du génome cœur obtenue des données de séquençage du génome complet (SGC) des 121 isolats d'Hia de patients représentant tous les ST identifiés et de la souche de l'ATCC a révélé deux populations phylogénétiques, tous les isolats du complexe ST-23 se trouvant à l'intérieur d'une population. L'autre population phylogénétique comprenait la souche de l'ATCC et les isolats de trois patients seulement. Les séquences concaténées hitABC récupérées des données du SCG et analysées par l'alignement MEGA (« Molecular Evolutionary Genetic Analysis ») ont confirmé la phylogénie obtenue par SNVPhyl. Les gènes sodC ont été trouvés seulement chez les isolats de la population phylogénétique mineure. Les deux populations phylogénétiques des isolats d'Hia canadiens sont similaires aux deux divisions clonales décrites pour H. influenzae de sérotype b. La combinaison du MLST, du SNVPhyl cœur et de l'alignement des séquences du gène hitABC ont montré que presque tous les isolats d'Hia des patients canadiens (99,4 %) appartenaient à une population phylogénétique majeure. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]