학술논문
Gram-Negatif Bakterilerde Moleküler ve Moleküler Olmayan Yöntemlerle Karbapenemazların Tanımlanmasının Karşılaştırılması.
Document Type
Article
Author
Source
Subject
*POLYMERASE chain reaction
*DESCRIPTIVE statistics
*GENE expression
*COMPARATIVE studies
*CEFTAZIDIME
*GENOTYPES
*PHENOTYPES
*GRAM-negative bacteria
*ALGORITHMS
*SENSITIVITY & specificity (Statistics)
*
*
*
*
*
*
*
*
*
Language
Turkish
ISSN
1301-143X
Abstract
Amaç: Karbapenemlere dirençli Gram-negatif çomak (KRGNÇ) infeksiyonlarının tedavisini planlarken, karbapenemaz varlığının ve karbapenemaz tipinin değerlendirilmesi önemli olmakla birlikte genotipik yöntemlerin rutinde kullanımı teknik donanım ve deneyimli personel gerektirdiğinden uygulanması her zaman mümkün olamayabilir. Bu nedenle özellikle kaynakları sınırlı ülkelerde ucuz, güvenilir, deneyim gerektirmeyen ve günlük pratikte kolaylıkla uygulanabilecek fenotipik yöntemler bir alternatiftir. Bu çalışmada, KRGNÇ'lerdeki karbapenemaz varlığı ve ülkemizde karbapenem direncinin en önemli nedenlerinden olan blaOXA-48 ve blaNDM genlerini veya her iki geni birden taşıyan suşları ayırt etmede kullanılan moleküler olmayan, ucuz ve kolay yapılabilen yöntemlerin etkinliği değerlendirilerek bir algoritma oluşturulmaya çalışıldı. Yöntemler: Çalışmaya, klinik örneklerde üreyen ve karbapeneme dirençli olduğu belirlenmiş 16 ardışık Gram-negatif çomak suşu dahil edildi. Karbapenemaz varlığını saptamak için fenotipik test olarak basitleştirilmiş karbapenem inaktivasyon metodu (simplified carbapenem inactivation method -- sCIM) ve modifiye Hodge testi (MHT); blaOXA-48, blaNDM ve blaKPC genlerini tanımlamak içinse moleküler yöntem olarak gerçek zamanlı polimerize zincir reaksiyonu (RT-PCR) testi kullanıldı. Karbapenemaz türlerinin ayrımı için fenotipik yöntemlerden yüksek düzey temosilin direnç testi ve seftazidim-avibaktam disk difüzyon duyarlılık testi uygulandı; testlerin sonuçlarıyla günlük pratikte karbapenemaz türlerinin fenotipik yöntemlerle tayini için bir algoritma oluşturuldu. Bulgular: Toplamda 16 suş değerlendirilmiş olup 12'sinde karbapenemaz geni saptandı; 11'inde sCIM, 10'unda MHT pozitif bulundu (duyarlılık sırasıyla %91.9 ve %83.3 idi). Enterobacterales suşlarının yedisinde blaOXA-48, birinde blaNDM, ikisinde blaNDM ve blaOXA-48 birlikte saptanmış olup hepsinde sCIM pozitifti. Karbapenemaz geni saptanan fakat sCIM negatif olan bir suş mevcuttu. Karbapenemaz geni saptanmayan dört suşun birinde sCIM pozitifti. Yüksek düzey temosilin direnci (MİK >128 μg/ml) izole blaOXA-48 taşıyan tüm suşlarda saptanırken, izole blaNDM taşıyan suşta gösterilemedi. Sonuç: Çalışmamızda moleküler yöntemlerle karbapenemaz geni saptanan Enterobacterales suşlarının tamamında sCIM pozitif saptandı. Verilerimiz literatürle uyumlu olarak, KRGNÇ'lerde sCIM'in karbapenemaz varlığının araştırılmasında günlük pratikte kullanılabileceğini destekler niteliktedir. [ABSTRACT FROM AUTHOR]