학술논문
甲醛固定石蜡包埋组织4种DNA提取方法的比较分析 / A Comparative Analysis of Four Different DNA Extraction Methods from Formalin-fixed Paraffin-embedded Tissue in Forensic Medicine
Document Type
Academic Journal
Author
黄静; 李琪睿; 李禹泽; 宋海迪; 刘安琪; 宋振祥; 赵晋远; 宣宇佳; 白慧茹; 霍志鑫; 易新容; 顾捷; 王亚丽; 陈丽琴; HUANG Jing; LI Qirui; LI Yuze; SONG Haidi; LIU Anqi; SONG Zhenxiang; ZHAO Jinyuan; XUAN Yujia; BAI Huiru; HUO Zhixin; YI Xinrong; GU Jie; WANG Yali; CHEN Liqin
Source
激光生物学报 / Acta Laser Biology Sinica. 32(5):441-449
Subject
Language
Chinese
ISSN
1007-7146
Abstract
本研究以10例甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)作为疑难检材,将其制成蜡膜,分别以二甲苯-Chelex100法、脱蜡液-Chelex100法、脱蜡液-Vazyme FastPure FFPE DNA Isolation试剂盒(简称FP试剂盒)、脱蜡液-北京天根石蜡包埋组织基因组提取试剂盒法(简称天根试剂盒)提取DNA,进行紫外分光光度计测定(浓度、纯度)及短串联重复序列(STR)分型检测(23个常染色体),通过比较分析FFPET在4种不同提取方法中的提取质量、STR分型质量和检出率,从而寻求一种高效简便、经济实用、方便快捷的甲醛固定石蜡包埋组织中DNA提取方法.结果表明:应用4种方法提取的石蜡包埋组织蜡膜DNA经紫外分光光度计测定后显示,应用2种Chelex100法提取的DNA浓度高于2款试剂盒,试剂盒提取的DNA的纯度优于另外2种方法,以上差异均具有统计学意义(P＜0.05);FP试剂盒提取DNA的平均浓度和纯度均优于天根试剂盒,无显著性差异(P＞0.05);STR分型普遍存在不同基因座和同一基因座不同等位基因之间的扩增不均衡,呈现前高后低状态;STR平均检出率为FP试剂盒＞天根试剂盒＞Chelex100法,2种Chelex100法STR基因座检出率比较无显著差异(P＞0.05),但分别和另外2种方法试剂盒方法相比有显著差异(P＜0.05),FP试剂盒和天根试剂盒法相比有显著差异(P＜0.05).因此,在涉及甲醛固定石蜡包埋组织这类疑难检材的法医DNA鉴定案件时,脱蜡液-Vazyme FastPure FFPE DNA Isolation试剂盒法优于其余3种提取DNA方法.