학술논문

Comprehensive Analysis of Circadian Genes in Diagnosis, Prognosis and Treatment Response in Breast Cancer / 晝夜節律基因在乳癌診斷、預後和治療反應的綜合分析
Document Type
Article
Source
秀傳醫學雜誌 / Show Chwan Medical Journal. p1-17. 17 p.
Subject
breast cancer
circadian rhythm genes
KLF9
diagnosis
prognosis
treatment response
乳癌
Kruppel樣因子9
診斷
預後
預測
藥物反應
Language
英文
繁體中文
ISSN
1561-0497
Abstract
乳癌是全球女性患者癌症相關死亡率的主要原因。晝夜節律基因與人類癌症之間的相關性已被確立,但對晝夜節律基因的臨床意義的綜合分析卻很少。分別使用TNMplot和KM Plotter網站工具確定基因表現的診斷和預後意義的分析。採用TNMplot的相關分析模組來分析從癌症基因組圖譜(TCGA)檢索的乳癌患者資料中兩個基因的Spearman相關性。使用基於公開存取的基因晶片資料庫的數據ROC曲線分析,以評估藥物反應的預測能力。KLF9、THRAP3、NPAS2、KLF9、CSNK1E和CSNK1D等晝夜節律基因中,在包括BRCA在內的大多數癌症類型中,KLF9在腫瘤中的表現量顯著低於正常組織。KLF9低表現與BRCA患者總存活時間較短有關。KLF9與已知的預後生物標記MKI67、PCNA、MCM2和GMNN呈現顯著負相關。在淋巴結陽性的BRCA患者中,抗HER2治療有反應者中觀察到KLF9低表現。值得注意的是,低/高KLF9表達量在抗HER2治療反應中表現出良好的預測準確性,曲曲線下面積達0.708。總之,KLF9的低表現可以作為乳癌以及多種癌症類型的差異生物標記。KLF9的低表現顯示病患預後較差,且預測淋巴結陽性的患者對抗HER2治療有良好的治療反應,為開發新的預後組和治療方法提供了可能的途徑。

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